Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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