Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col5a3Q9JLI2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Col5a3Q9JLI2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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