Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ldb3Q9JKS4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms