Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chrac1Q9JKP8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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