Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim54Q9ERP3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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