Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms