Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER97

Ngb, Neuroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgbQ9ER97 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NgbQ9ER97 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms