Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Tlr1Q9EPQ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr1Q9EPQ1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tlr1Q9EPQ1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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