Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms