Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufs3Q9DCT2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms