Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Susd2Q9DBX3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms