Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrn2Q9DBR1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms