Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms