Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms