Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smdt1Q9DB10 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smdt1Q9DB10 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smdt1Q9DB10 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smdt1Q9DB10 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smdt1Q9DB10 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smdt1Q9DB10 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms