Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms