Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem239Q9DA47 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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