Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms