Protein–RNA interactions for Protein: Q9D958

Spcs1, Signal peptidase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs1Q9D958 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spcs1Q9D958 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms