Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Snx5Q9D8U8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms