Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl17Q9D8P4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms