Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a2Q9D8F3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a2Q9D8F3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms