Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Echdc3Q9D7J9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Echdc3Q9D7J9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Echdc3Q9D7J9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Echdc3Q9D7J9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Echdc3Q9D7J9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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