Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4cQ9D7F7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms