Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Borcs6Q9D6W8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs6Q9D6W8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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