Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms