Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdr42e1Q9D665 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdr42e1Q9D665 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms