Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrameQ9D4Z5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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