Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms