Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpn3Q9D3W4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpn3Q9D3W4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpn3Q9D3W4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpn3Q9D3W4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpn3Q9D3W4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms