Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Trappc6bQ9D289 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Trappc6bQ9D289 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Trappc6bQ9D289 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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