Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms