Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms