Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18l2Q9D174 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms