Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rfc5Q9D0F6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms