Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms