Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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