Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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