Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms