Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CWU4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms