Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms