Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PclafQ9CQX4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms