Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms