Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms