Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms