Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Brms1Q99N20 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms