Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ms4a6dQ99N07 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms