Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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