Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms