Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PtprtQ99M80 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PtprtQ99M80 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PtprtQ99M80 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprtQ99M80 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms